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40%消費級基因檢測可能是錯的,大部分與癌癥有關(guān)!

2018-04-14 來源:醫(yī)健創(chuàng)投人  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:一般來說,原始數(shù)據(jù)的解讀很大程度上依賴于數(shù)據(jù)庫的大小與質(zhì)量(FDA并不允許商業(yè)測序公司提供健康診斷),消費者對應(yīng)的人種在數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)越少,報告的可信度就越低,一些情況下,如果第三方解讀公司選擇的數(shù)據(jù)庫質(zhì)量不佳失之毫厘,最終的報告結(jié)果很可能就謬以千里了。

隨著測序技術(shù)的進(jìn)步,人類正在試圖解讀自己,醫(yī)生通過基因測序?qū)颊哌M(jìn)行快速的診斷,普通人則希望解開“身世”之謎:了解家族歷史、遺傳疾病潛在風(fēng)險,更好的規(guī)劃生活,規(guī)范行為,這一需求促使著直接面向顧客(direct-to-consumer,DTC)類測序服務(wù)的飛速發(fā)展,數(shù)以百萬計的消費者向生物技術(shù)公司提供一點唾液來獲得自身部分的遺傳信息。但是,根據(jù)發(fā)表在3月份Nature子刊《GeneticsinMedicine》上的一份研究顯示40%的消費級基因檢測可能是錯的,其中大部分與癌癥有關(guān)。

雖然此次研究的樣本量小,但首次揭示了DTC測試的解讀與實驗室診斷性基因測試的巨大差異,也提醒消費者不要過度依賴商業(yè)測序結(jié)果,當(dāng)出現(xiàn)負(fù)面結(jié)果時不要過度驚慌,應(yīng)及時與醫(yī)生溝通,選擇進(jìn)一步的臨床醫(yī)療診斷。

測序的原始數(shù)據(jù)(rawdata)對于普通人來說簡直可以算得上是天書,沒有專業(yè)的解讀,原始的基因位點信息對于普通消費者來說幾乎沒有任何價值,而目前FDA也禁止大多數(shù)DTC公司提供診斷性的基因檢測。

但是現(xiàn)在,消費者可以通過相應(yīng)的測序公司或其他第三方公司,根據(jù)原始數(shù)據(jù)為其提供基因分型信息,得知獲得某種疾病的潛在風(fēng)險。但由于缺少臨床試驗確認(rèn),誤讀再所難免,可如果說誤讀居然達(dá)到40%,我們又該如何理性看待呢?

蓬勃發(fā)展的測序市場,真假如何?

證明結(jié)果是不是可信,要用數(shù)據(jù)來說話。

在此次研究中,基因診斷公司AmbryGenetics的研究人員重新分析了49例DTC的原始數(shù)據(jù),并與臨床試驗數(shù)據(jù)進(jìn)行比對。結(jié)果發(fā)現(xiàn),只有60%的致病突變?yōu)檎鎸嵉模溆?0%為假陽性,其中絕大多數(shù)都是與癌癥相關(guān)的基因。除此之外,一些被認(rèn)定為“高危突變”的基因也被重新認(rèn)定為良性的“常見突變”。

一般來說,原始數(shù)據(jù)的解讀很大程度上依賴于數(shù)據(jù)庫的大小與質(zhì)量(FDA并不允許商業(yè)測序公司提供健康診斷),消費者對應(yīng)的人種在數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)越少,報告的可信度就越低,一些情況下,如果第三方解讀公司選擇的數(shù)據(jù)庫質(zhì)量不佳失之毫厘,最終的報告結(jié)果很可能就謬以千里了。

該文章的第一作者、Ambry遺傳咨詢師StephanyLeighTandy-Connor在一份聲明中表示,在這項特定研究中,假陽性率如此之高是出乎他們意料的,這也讓他們對現(xiàn)今DTC基因檢測的準(zhǔn)確性感到擔(dān)憂。

而這些錯誤也提醒我們正視專家及咨詢師數(shù)年來對公眾提出的警告:直接面向消費者的基因測序結(jié)果應(yīng)該在專家的協(xié)助下解讀,尤其在設(shè)計疾病風(fēng)險時,更需要進(jìn)行進(jìn)一步的臨床檢測。由于疾病是由于基因、環(huán)境及生活方式共同作用,遺傳風(fēng)險并不能“一錘定音”。

盡管此次研究并未提及初始報告的給出公司,但也實在是不難猜測,因為如今DTC商業(yè)測試市場上撥弄風(fēng)云的也不外乎就是這幾家公司:FamilyTreeDNA,MyHeritage,23andMe,ancestry.com。

單就23andMe這家公司而言,這幾年可謂風(fēng)光無限。這家位于美國加州的基因檢測公司累計融資超過7億美元,估值超過10億美元,在多年的經(jīng)營中,已累積超過二百萬名顧客,超過2億美元的收入。預(yù)計在未來5年內(nèi),DTC測序市場的規(guī)模將達(dá)到3.4億美元。

只要愿意付出79美元和幾口唾沫,消費者就會得到家族歷史的遺傳信息,如果愿意再掏出80美元,你將在原始數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上獲得多項解讀,包括遺傳健康風(fēng)險、血統(tǒng)信息、健康狀況等。如果同時獲取配偶的具體情況,甚至可以算出孩子患有遺傳疾病的概率。

而23andMe這只獨角獸也表明了當(dāng)仁不讓的態(tài)度:2015年,美國食品及藥物管理局(FDA)批準(zhǔn)第一個面向消費者的遺傳病基因(Bloom綜合征)檢測,該服務(wù)由23andMe提供;2017年,F(xiàn)DA批準(zhǔn)首個面向消費者的10項疾病的基因檢測,并授權(quán)23andMe進(jìn)行檢測,值得一提的是,23andMe也是唯一一家獲FDA批準(zhǔn)的直接面向消費者的基因檢測公司。

今年3月,美國FDA宣布23andMe獲得首個直接面向消費者的癌癥風(fēng)險基因檢測授權(quán),主要針對與乳腺癌、卵巢癌前列腺癌風(fēng)險相關(guān)特定突變基因的檢測。這種試劑盒可以檢測三種已知可以使人患癌癥的基因突變,但仍有數(shù)百種的其他突變并未參與檢測。

而23andMe首席執(zhí)行官兼聯(lián)合創(chuàng)始人AnneWojcicki則表示,公司提供的DTC基因檢測結(jié)果與DNA測序技術(shù)的金標(biāo)準(zhǔn)Sanger測序的一致性超過99%,并通過研究證明,重復(fù)性和可重復(fù)性大于99%,具有極高的準(zhǔn)確性和精確性,并能保證安全性和有效性。

Tandy-Connor也指出,此次研究結(jié)果同樣突出了對DTC基因檢測結(jié)果進(jìn)行驗證確認(rèn)的必要性。隨著基因技術(shù)的發(fā)展,未來DTC基因檢測的準(zhǔn)確性能夠有大幅提升,但在這個過程中,有關(guān)去偽求真的討論不應(yīng)該停止。

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