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Nature子刊:CRISPR再立功,人類首次實(shí)時(shí)觀測(cè)活細(xì)胞內(nèi)基因運(yùn)動(dòng)

2017-04-25 來源:藥學(xué)進(jìn)展  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:這一新方法克服了基因成像長(zhǎng)期以來存在的限制?!拔覀?cè)桓嬷@是永遠(yuǎn)都做不到的,” Mazhar Adli教授說道:“是有一些方法能讓你看到三維組織結(jié)構(gòu)

  Nature子刊:CRISPR再立功,人類首次實(shí)時(shí)觀測(cè)活細(xì)胞內(nèi)基因運(yùn)動(dòng)

  對(duì)于弗吉尼亞大學(xué)(University of Virginia)Mazhar Adli教授來說,這些在電腦屏幕上飛舞的小點(diǎn)點(diǎn),代表了他夢(mèng)想的實(shí)現(xiàn)。這些熒光點(diǎn)的實(shí)時(shí)移動(dòng),指明了一種從未有過的方式,讓我們有望對(duì)人類基因組、癌癥遺傳疾病產(chǎn)生新的理解。

  新技術(shù)對(duì)HeLa細(xì)胞17號(hào)染色體上一個(gè)片段的實(shí)時(shí)觀測(cè)(圖片來源:《Nature Communications》)

  Mazhar Adli教授的團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種能夠?qū)崟r(shí)跟蹤活細(xì)胞內(nèi)基因的方法,可以讓特定的基因片段發(fā)光。這樣,人們就能夠以三維的視角觀測(cè)到基因在細(xì)胞內(nèi)的位置和運(yùn)動(dòng)路徑,就像用天文望遠(yuǎn)鏡觀察太空中的星星一樣。這一重要突破發(fā)表在近期的《自然》子刊《Nature Communications》上。

  在細(xì)胞中的定位以及與其他基因的相對(duì)位置,會(huì)對(duì)一個(gè)基因的效應(yīng)產(chǎn)生重要的影響。 因此,針對(duì)特定基因在細(xì)胞中的三維定位將有望幫助科學(xué)家以一種新的視角,大大加深對(duì)我們理解基因如何工作和相互作用,以及對(duì)我們健康的影響。

  “這個(gè)夢(mèng)我已經(jīng)做了很久,”Mazhar Adli教授說道:“我們能夠在活細(xì)胞中對(duì)基因組中幾乎任何一個(gè)區(qū)域進(jìn)行實(shí)時(shí)觀測(cè),而且效果很好。采取傳統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)方法,你基本上永遠(yuǎn)都不會(huì)得到這樣的數(shù)據(jù),因?yàn)槟惚仨殮⑺兰?xì)胞才能進(jìn)行此種成像,但是我們現(xiàn)在卻可以在活細(xì)胞中做到實(shí)時(shí)成像。”

  盡管DNA是線性分子,但也會(huì)折疊成三維結(jié)構(gòu)。這時(shí),原本在DNA鏈上線性距離很遠(yuǎn)的兩個(gè)基因,也可能會(huì)相互接近,進(jìn)而發(fā)生影響基因功能發(fā)揮的相互作用。

  新方法采用了CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)。研究者在單鏈引導(dǎo)RNA(sgRNA)的尾部連接了16個(gè)重復(fù)的MS2 RNA片段,配以失去核酸酶活性的dCas9酶,以避免破壞靶標(biāo)基因。MS2片段源自噬菌體,其折疊結(jié)構(gòu)可與MS2被殼蛋白(MCP)結(jié)合。這時(shí),若以熒光基因標(biāo)記MCP,便可在光學(xué)顯微鏡下對(duì)特定基因進(jìn)行活細(xì)胞成像。實(shí)驗(yàn)顯示,如果增加MS2片段的重復(fù)次數(shù),則可顯著提高信噪比和靈敏度,即便對(duì)于低重復(fù)和非重復(fù)基因片段也能進(jìn)行三維觀察。此外,研究者還可以使用CRISPR技術(shù),將特定基因“打開”或“關(guān)閉”,然后再來看看會(huì)細(xì)胞內(nèi)發(fā)生什么。

  這一新方法克服了基因成像長(zhǎng)期以來存在的限制。“我們?cè)桓嬷@是永遠(yuǎn)都做不到的,” Mazhar Adli教授說道:“是有一些方法能讓你看到三維組織結(jié)構(gòu),但是你必須對(duì)數(shù)以億計(jì)的細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn),而且得先殺死這些細(xì)胞。我們現(xiàn)在可以在單細(xì)胞水平直接觀察活細(xì)胞,可以對(duì)那里發(fā)生的一切進(jìn)行錄像。”

  為了成像而培養(yǎng)大量的細(xì)胞并將其殺死,是一件十分耗時(shí)的事情,并且難以弄清楚細(xì)胞內(nèi)部的DNA究竟經(jīng)歷了什么,就像很難從球賽的剪影中看懂足球的規(guī)則。Mazhar Adli教授團(tuán)隊(duì)開發(fā)的新方法,就好比能讓人們坐下來,完整地觀看一場(chǎng)球賽的錄像。“這是一個(gè)十分激動(dòng)人心的事情,”他說道。

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