Nature子刊：用高通量免疫測(cè)序診斷病毒感染

2017-04-06 來(lái)源：藥明康德標(biāo)簽：掌上醫(yī)生喝茶減肥一天瘦一斤安全減肥 cps聯(lián)盟美容護(hù)膚

摘要：AdaptiveBiotechnologies是高通量測(cè)序領(lǐng)域的先驅(qū)性公司和領(lǐng)軍企業(yè)之一，其專(zhuān)長(zhǎng)于結(jié)合生物信息學(xué)來(lái)鑒定分析T細(xì)胞和B細(xì)胞受體。

　　今天，藥明康德合作伙伴AdaptiveBiotechnologies宣布在《自然》子刊《NatureGenetics》上發(fā)表創(chuàng)新型研究論文，結(jié)果證明可提供一種潛在的新穎方法診斷慢性病毒感染。

　　AdaptiveBiotechnologies是高通量測(cè)序領(lǐng)域的先驅(qū)性公司和領(lǐng)軍企業(yè)之一，其專(zhuān)長(zhǎng)于結(jié)合生物信息學(xué)來(lái)鑒定分析T細(xì)胞和B細(xì)胞受體。這家公司的immunoSEQ平臺(tái)幫助科研人員在腫瘤學(xué)、自身免疫疾病、傳染病和基礎(chǔ)免疫學(xué)等領(lǐng)域展開(kāi)前沿研究。以服務(wù)或試劑盒形式，immunoSEQ測(cè)定方法可以高度精細(xì)地從單個(gè)樣品中鑒定分析數(shù)百萬(wàn)個(gè)T細(xì)胞和B細(xì)胞受體。該immunoSEQ平臺(tái)分析工具可提供定量、可重復(fù)的測(cè)序結(jié)果，加上其強(qiáng)大的訪(fǎng)問(wèn)功能以及易于使用的特性，Adaptive免疫測(cè)序平臺(tái)的準(zhǔn)確性和靈敏度優(yōu)勢(shì)已經(jīng)逐步入駐世界各地的實(shí)驗(yàn)室，推動(dòng)癌癥和其他免疫介導(dǎo)疾病的突破性研究；同時(shí)，該公司也將免疫測(cè)序發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為臨床診斷和治療手段，以改善患者的護(hù)理水平。

　　這篇題為“ImmunosequencingidentifiessignaturesofcytomegalovirusexposurehistoryandHLA-mediatedeffectsontheTcellrepertoire”的文章正是描述了Adaptive的計(jì)算生物學(xué)家如何使用該公司的immunoSEQ平臺(tái)和數(shù)據(jù)集，通過(guò)免疫測(cè)序手段來(lái)確定分析T細(xì)胞受體譜系，最終用于診斷人類(lèi)巨細(xì)胞病毒（CMV）感染的暴露狀態(tài)。

　　Adaptive的這項(xiàng)研究是由FredHutchinson癌癥研究中心部分資助的。研究共同作者選擇了CMV進(jìn)行原理驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，這是因?yàn)樵摷膊〖s占成年人慢性病毒感染的30％？90％，并被廣泛研究后建立成為公眾人群T細(xì)胞應(yīng)答的模型系統(tǒng)。使用公共數(shù)據(jù)，Adaptive的研究團(tuán)隊(duì)分析了666名受試者核心隊(duì)列的T細(xì)胞受體全譜系，以及另外120名受試者的獨(dú)立驗(yàn)證隊(duì)列。研究小組制定了一個(gè)統(tǒng)計(jì)計(jì)算框架，通過(guò)CMV感染狀態(tài)對(duì)受試者進(jìn)行分類(lèi)，然后高精度確認(rèn)了免疫測(cè)序方法可被用于診斷CMV的感染狀態(tài)。此外，該團(tuán)隊(duì)使用這種方法證明它在預(yù)測(cè)受試者的人類(lèi)白細(xì)胞抗原（HLA）等位基因方面也表現(xiàn)良好，表明該方法可用于識(shí)別暴露于其他病原體的生物標(biāo)志，甚至疫苗接種狀態(tài)。

　　AdaptiveBiotechnologies的聯(lián)合創(chuàng)始人兼創(chuàng)新主管HarlanRobins博士說(shuō)道：“我們認(rèn)為通過(guò)讀取T細(xì)胞記憶來(lái)推斷病原體暴露歷史的方法具有令人興奮的潛力。這是一個(gè)重要步驟，我們旨在將免疫測(cè)序驗(yàn)證為針對(duì)各種慢性病毒感染的高敏感度、高特異性和高效益的診斷方法。”

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本品用于免疫損傷引起巨細(xì)胞病毒感染的患者。 1、用于免疫功能損傷(包括艾滋病患者)發(fā)生的巨細(xì)胞病毒性視網(wǎng)膜炎的維持治療。 2、預(yù)防可能發(fā)生干器官移植受者的巨細(xì)胞病毒感染。 3、預(yù)防晚期HIV感染患者的巨細(xì)胞病毒感染。

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本品用于免疫損傷引起巨細(xì)胞病毒感染的患者。 1、于免疫功能損傷（包括艾滋病患者）發(fā)生的巨細(xì)胞病毒性視網(wǎng)膜炎的維持治療。 2、預(yù)防可能發(fā)生于器官移植受者的巨細(xì)胞病毒感染。 3、預(yù)防晚期HIV感染患者的巨細(xì)胞病毒感染。

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1、單純皰疹病毒感染：用于生殖器皰疹病毒感染的初始發(fā)作和復(fù)發(fā)瘸例．對(duì)反復(fù)發(fā)作的病例口服本品用作預(yù)防。2、帶狀瘟疹感染：用于免疫功能正常者的帶狀皰疹和免疫缺陷者輕癥病例的治療。

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1.唐草片：清熱解毒、活血益氣。用于艾滋病毒感染者以及艾滋病患者(CD4淋巴細(xì)胞在100-400個(gè)/mm 3之間)，有提高CD4淋巴細(xì)胞計(jì)數(shù)作用，可改善乏力、脫發(fā)、食欲減退和腹瀉等癥狀，改善活動(dòng)功能狀況。 2.齊多拉米雙夫定片：適用于HIV感染的成人及12歲以上兒童，這些病人有進(jìn)行性免疫缺陷。本品可降低HIV-1的病毒量，增加CD4+細(xì)胞數(shù)。

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1.鬼臼毒素酊(東信威)：男、女外生殖器及肛門(mén)周?chē)课坏募怃J濕疣。 2.鹽酸伐昔洛韋片(麗珠威)：用于治療水痘帶狀皰疹及I型、II型單純皰疹病毒感染，包括初發(fā)和復(fù)發(fā)的生殖器皰疹病毒感染。本品可用于阿昔洛韋的所有適應(yīng)癥。 3.斑蝥素乳膏(尤斯洛)：用于治療尖銳濕疣。 4.轉(zhuǎn)移因子口服溶液：用于某些抗生素難以控制的病毒性或霉菌性細(xì)胞內(nèi)感染的輔助治療（如帶狀皰疹、流行性乙型腦炎、白色念球菌感染

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