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打破常規(guī)!發(fā)現(xiàn)獨特的DNA編輯功能

摘要:人們的常規(guī)看法是被認為是非編碼性“垃圾”的DNA對這種有機體沒有用處,在從有機體的基因組中切除后會很快地遭受降解。

  一種單細胞纖毛蟲物種以一種看似不可能的方式使用細胞轉(zhuǎn)錄復(fù)合體。在一項新的研究中,來自瑞士伯爾尼大學(xué)的研究人員首次詳細地描述了“垃圾DNA”在遭受降解之前轉(zhuǎn)錄的機制。這種機制是非常巧妙的。

  它聽起來像是一場設(shè)計競賽中的獲獎設(shè)計方案:當小片段信息太短而不適合放入讀取設(shè)備中時,如何讀取這些小片段信息呢?將它們縫接在一起形成一條更長的鏈,然后將這條鏈閉合,從而產(chǎn)生一種便于使用的環(huán)。這種環(huán)甚至能夠被這種讀取設(shè)備重復(fù)地讀取。這就是一種被稱作第四雙小核草履蟲(Parameciumtetraurelia)的單細胞纖毛蟲物種如何將小切離DNA片段(excisedDNAsegment)轉(zhuǎn)錄為具有調(diào)節(jié)功能的小RNA。

  當來自伯爾尼大學(xué)細胞生物學(xué)研究所的MariuszNowacki發(fā)現(xiàn)小RNA在清除來自草履蟲DNA的片段中發(fā)揮著調(diào)節(jié)的功能時,他和他的團隊研究起了其中的分子機制:這些小RNA是怎么產(chǎn)生的?它們的確切功能是什么?他們很快發(fā)現(xiàn)在對DNA片段的清除中似乎存在一種反饋循環(huán)。這些DNA片段之前被認為是沒有用處的。它們是從草履蟲基因組中切離出來的,隨后被降解掉。然而,在降解之前,它們起著小RNA模板的作用,它們所產(chǎn)生的小RNA接著有助切割出更多的這些DNA片段。一旦啟動,這種金字塔式系統(tǒng)即通過產(chǎn)生小RNA自我強化。

  讓不能夠轉(zhuǎn)錄的DNA片段發(fā)生轉(zhuǎn)錄

  盡管這種系統(tǒng)看似如此美麗和迷人,但是這些研究人員也遇到一個嚴重的問題:通常,細胞轉(zhuǎn)錄復(fù)合體需要更長的DNA片段才能運作,因此這些小切離DNA片段(長度甚至不到30個堿基對)如何能夠起著模板的作用?如果針對這一點沒有一種很好的解釋,那么這整個理論看起來是非常難以置信的。Nowacki回憶道,“這是一種有趣的偵探工作。”他們作出一種猜測:所有他們需要做的事情是證明這種猜測。“我們事實上并不是尋找未知的世界,這是因為我們很快有一種新的想法,隨后就是測試這種想法。”他們的猜測經(jīng)證實是正確的:草履蟲找出一種方法將小切離DNA片段隨機地串聯(lián)在一起形成一條鏈,一旦這條鏈達到合適的長度(大約200個堿基對),就將它的末端連接在一起形成這些小切離DNA片段的環(huán)形串聯(lián)體。這些環(huán)形串聯(lián)體經(jīng)轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生雙鏈RNA。所產(chǎn)生的雙聯(lián)RNA在Dicer樣蛋白的切割下產(chǎn)生一群具有調(diào)節(jié)功能的小RNA,而且這些小RNA與小切離DNA片段在序列上準確地匹配。

  垃圾DNA或者不是垃圾DNA?

  這一發(fā)現(xiàn)具有重要的分子生物學(xué)意義。人們的常規(guī)看法是被認為是非編碼性“垃圾”的DNA對這種有機體沒有用處,在從有機體的基因組中切除后會很快地遭受降解。但是,事實上,它們是一類具有生物學(xué)重要性的小RNA的功能性模板。它們確實是分子生物學(xué)上的重大的新興領(lǐng)域之一:垃圾DNA是否真的是無價值的,這是因為越來越明顯的是:它們確實具有調(diào)節(jié)功能。Nowacki認為在這項研究中,他的團隊是首次能夠闡明這種切離的“垃圾DNA”的精確轉(zhuǎn)錄機制,這就進一步證實它們應(yīng)當改名了。

  RNA與疾病---RNA生物學(xué)功能在疾病機制中的作用

  Nowacki團隊研究了一類長期被忽視的分子:RNA。它們在很多重要的過程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用,而且比初始認為的更加復(fù)雜。比如,在一個特定的細胞中,RNA決定了一個給定的基因在何種條件下激活或滅活。如果這種基因調(diào)節(jié)過程的任何一個部分發(fā)生故障或者不能夠平穩(wěn)運行的話,那么它能夠?qū)е?a target="_blank" href="http://m.xataih.com/xnxgpd/" name="InnerLinkKeyWord">心臟病、癌癥、腦部疾病和代謝疾病。

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