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張鋒發(fā)現(xiàn)靶向RNA“新魔剪”,CRISPR家族再次壯大!

摘要:研究發(fā)現(xiàn),Cas13b具有靶向和編輯RNA的能力。僅靶向RNA的這一能力使得研究人員能夠以高通量地方式特異性地操縱RNA,從而用于研究廣泛的生物過程。

  近日,發(fā)表在MolecularCell雜志上題為“Cas13bIsaTypeVI-BCRISPR-AssociatedRNA-GuidedRNaseDifferentiallyRegulatedbyAccessoryProteinsCsx27andCsx28”的研究中,張鋒帶領(lǐng)的研究小組發(fā)現(xiàn)了兩個新型的RNA靶向CRISPR系統(tǒng)。這類新系統(tǒng)利用了一種新的Cas酶——Cas13b。

  研究發(fā)現(xiàn),Cas13b具有靶向和編輯RNA的能力。僅靶向RNA的這一能力使得研究人員能夠以高通量地方式特異性地操縱RNA,從而用于研究廣泛的生物過程。

  Broad研究所的報道稱,為尋找CRISPR系統(tǒng),張鋒實驗室采用計算機(jī)數(shù)據(jù)挖掘方法搜尋了不同微生物的基因組。不同于先前的生物信息學(xué)方法,張鋒和他的研究小組致力于尋找缺乏cas1基因(與CRISPR免疫力相關(guān)的最常見的基因)的系統(tǒng),以期找到新的CRISPR系統(tǒng)。

  這一新發(fā)現(xiàn)的酶與張鋒研究組去年6月在Science雜志上(論文:C2c2isasingle-componentprogrammableRNA-guidedRNA-targetingCRISPReffector)提出的Cas13a(先前被稱為C2c2,一種RNA靶向酶)有一些共同的特性。

  像Cas13a一樣,Cas13b僅需要單個向?qū)NA就能找到靶標(biāo),并且從遺傳學(xué)的角度是可編碼的。此外,Cas13b能夠同時靶向多個RNA轉(zhuǎn)錄本。但Cas13b也有一些獨特的特點,表明它與Cas13a是不同的。這些特性使得Cas13b更適用于微調(diào)基因功能。

  該研究的共同第一作者NeenaPyzocha說:“Cas13b是一個最新的基因編輯工具。我們期望它能夠在未來支持一些研究進(jìn)展的產(chǎn)生。”

  Cell重要文章:一圖詳解2類CRISPR系統(tǒng)

  事實上,此次發(fā)現(xiàn)的CRISPR-Cas13b屬于2類VI-B型CRISPR系統(tǒng)。小編注意到,今年1月,張鋒在Cell雜志上發(fā)表了一篇題為“SnapShot:Class2CRISPR-CasSystems”的SnapShot,對2類CRISPR系統(tǒng)進(jìn)行了詳細(xì)的歸納(見文末圖)。

  文章稱,CRISPR-Cas系統(tǒng)是在原核生物中發(fā)現(xiàn)的適應(yīng)性免疫系統(tǒng),基于不同的效應(yīng)蛋白被分為兩類。1類CRISPR-Cas系統(tǒng)利用多個蛋白效應(yīng)器復(fù)合物(multi-proteineffectorcomplexes),而2類CRISPR-Cas系統(tǒng)利用單個蛋白效應(yīng)器?;诓煌男?yīng)蛋白家族,2類CRISPR-Cas系統(tǒng)被分為3種類型,9個亞型。第10個亞型還有待證明。

  文章具體介紹了不同亞型的2類CRISPR-Cas系統(tǒng)的作用機(jī)制、起源與進(jìn)化,以及應(yīng)用方向。作者們認(rèn)為,從概念上說,主要包括三個方面的應(yīng)用:1)基因編輯,包括基因敲除、基因敲入以及引發(fā)突變;2)基因調(diào)控以及遞送各種功能的部件(如轉(zhuǎn)錄因子)到DNA中獨特的位置;3)利用Cas13(VIeffector)靶向ssRNA。

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