1)腎臟癌腫：呈占位性病變，但易發(fā)于深部，從而引起更明顯的腎盞彎曲，血尿常見，而囊腫則不見，當腎實質腫瘤壓在腰大肌上面，在腹平片上就看不到肌肉的邊緣，而囊腫則依舊可見，出現(xiàn)轉移的證據(jù)(如體重減輕，乏力，觸及鎖骨上淋結腫大，片顯示有轉移性結節(jié))，紅細胞增多癥，高鈣血癥及血沉加快都提示為癌腫，需記住的是，囊腫壁也會發(fā)生癌性變，若腎靜脈被癌腫堵塞，排泄性尿路造影就不清楚甚或不顯影，超聲影象及CT總是最后用來做鑒別診斷，血管造影及腎斷層X光攝影術可顯示在含豐富血管的腫瘤中，有一造影劑密集的“池塘”，而囊腫密度則不受影響，在被證明是其他疾病前，將所有腎臟占位性病變都假定為癌腫是明智的。

　　(2)多囊腎：正如尿路造影所示，本病幾乎總是雙側性的，彌漫的腎盞及腎盂發(fā)生扭曲已成其規(guī)律，單純性腎囊腫則多為孤立性單發(fā)性，多囊腎往往伴有腎功能損害及高血壓，而腎囊腫則沒有， (3)腎癰：本病罕見，采集病史時，可發(fā)現(xiàn)在突起發(fā)熱及局部疼痛前數(shù)周有過皮膚感染史，尿路造影顯示其病變與囊腫及腫瘤相似，但由于腎周圍炎影響，使腎輪廓及腰大肌影模糊不清，此時，腎臟多較固定，將患者在仰臥及直立時腎臟位置加以比較即可證實，血管造影可顯示一無血管的病損，鎵-67掃描可顯示病損的炎癥性質，但感染的單純性腎囊腫也可有相似的表現(xiàn)，

　　(4)腎積水：癥狀和體征可與單純性腎囊腫的表現(xiàn)完全一致，但尿路造影則截然不同，囊腫引起腎臟變形，而腎積水則表現(xiàn)為由于梗阻所致的腎盞和腎盂的擴張，急性或亞急性腎盂積水由于腎盂內(nèi)壓的增高常產(chǎn)生更為局限的疼痛，并因感染而易于使其表現(xiàn)復雜化，(5)腎外腫瘤(如腎上腺，混合性后腹膜肉瘤)：可使腎臟移位，但很少侵及腎臟并使腎盞變形，

　　(6)能包蟲病：其囊腫未與腎盂相通時，難以和單純性腎囊腫鑒別，因尿中尚不會有包蟲及其幼蟲，在X線檢查中常發(fā)現(xiàn)腎包蟲病囊腫壁上有鈣化，皮膚敏感試驗時診斷該病有所幫助。