與大細(xì)胞癌相區(qū)分的依據(jù)是鱗狀分化是否存在。局部可存在胞內(nèi)粘蛋白。即使侵襲性生長未得到確定，如果具有明顯的細(xì)胞不典型也可確定乳頭狀型SCC的診斷。小的活檢標(biāo)本表現(xiàn)分化良好的乳頭狀鱗狀上皮時診斷應(yīng)謹(jǐn)慎，因?yàn)槿轭^狀鱗癌與乳頭狀瘤的區(qū)分是困難的。肺的疣狀癌非常罕見，包括在乳頭狀鱗癌之中。前縱隔組織廣泛侵襲可導(dǎo)致與胸腺鱗狀細(xì)胞癌鑒別診斷困難，需要與手術(shù)和放射學(xué)檢查結(jié)果相結(jié)合。在 肺間質(zhì)中，鱗狀細(xì)胞癌可被肺泡細(xì)胞包繞，有時可被誤診為腺鱗癌。在彌漫性肺泡破壞（DAD）中存在鱗狀化生伴細(xì)胞不典型應(yīng)考慮鱗狀細(xì)胞癌的可能。DAD的一般特征表現(xiàn)如透明膜、彌漫性肺泡隔結(jié)締組織增生伴肺泡細(xì)胞增生和 細(xì)支氣管中心性鱗化等有利于認(rèn)為DAD是一種化生的病變過程。