(一)病理診斷
1.肝組織學檢查證實為原發(fā)性肝癌者
2.肝外組織的組織學檢查證實為肝細胞癌
(二)臨床診斷
1.如無其他肝癌證據，AFP對流法陽性或放免法AFP>400mg/ml持續(xù)四周以上并能排除妊娠活動性肝病生殖腺胚胎源性腫瘤及轉移性肝癌者。
2.B型超生顯像可顯示直徑2cm以上的腫瘤，對早期定位檢查有較大的價值;電子計算機X線體層攝影(CT) 可顯示直徑1.0cm以上的腫瘤;放射性核素掃描能顯示直徑3-5cm以上的腫瘤;其它X線肝血管造影、核磁共振像對肝癌診斷有一定價值。
3.影像學檢查有明確肝內實質性占位病變能排除肝血管瘤和轉移性肝癌并具有下列條件之一者：
①AFP>20mg/ml②典型的原發(fā)性肝癌影像學表現③無黃疸而AKP或r-GT明顯增高④遠處有明確的轉移性病灶或有血性腹水或在腹水中找到癌細胞⑤明確的乙型肝炎標志物陽性的肝硬化。 

肝癌鑒別診斷
1、繼發(fā)性肝癌：繼發(fā)性肝癌與原發(fā)性肝癌比較，繼發(fā)性肝癌病情發(fā)展緩慢，癥狀較輕，其中以繼發(fā)于胃癌的最多，其次為肺、結腸、胰腺、乳腺等的癌灶常轉移至肝。常表現為多個結節(jié)型病灶，甲胎蛋白(AFP)檢測除少數原發(fā)癌在消化的病例可陽性外，一般多為陰性。
2、肝硬化：肝癌多發(fā)生在肝硬化的基礎上，兩者鑒別常有困難。鑒別在于詳細病史、體格檢查聯(lián)系實驗室檢查。肝硬化病情發(fā)展較慢有反復，肝功能損害較顯著，血清甲胎蛋白(AFP)陽性多提示癌變。
3、活動性肝病：以下幾點有助于肝癌與活動性肝病(急慢性肝炎)的鑒別。AFP甲胎球蛋白檢查和SGPT谷丙轉氨酶必須同時檢測。
4、肝膿腫：表現發(fā)熱、肝區(qū)疼痛、有炎癥感染癥狀表現，白細胞數常升高，肝區(qū)叩擊痛和觸痛明顯，左上腹肌緊張，周圍胸腔壁常有水腫。
5、肝海綿狀血管瘤:該病為肝內良性占位性病變，常因查體B型超聲或核素掃描等偶然發(fā)現。該病我國多見。鑒別診斷主要依靠甲胎蛋白測定，B型超聲及肝血管造影。
6、肝包蟲病:患者有肝臟進行性腫大，質地堅硬和結節(jié)感、晚期肝臟大部分被破壞，臨床表現極似原發(fā)性肝癌。
7、鄰近肝區(qū)的肝外腫瘤：如胃癌、上腹部高位腹膜后腫瘤，來自腎、腎上腺、結腸、胰腺癌及腹膜后腫瘤等易與原發(fā)性肝癌相混淆。除甲胎蛋白多為陰性可助區(qū)別外，病史、臨床表現不同，特別超聲、CT、 MRI等影像學檢查、胃腸道X線檢查等均可作出鑒別診斷。