臨床表現多種多樣，大體上類似于其他的兼性革蘭染色陰性桿菌?？杀憩F為皮膚、軟組織、呼吸道、泌尿道、中樞神經系統(tǒng)、胃腸道和其他的器官的感染。
1.敗血癥 多發(fā)生在老人或新生兒中，有時伴有其他細菌混合感染。在成人和兒童中常伴發(fā)熱，并多有寒戰(zhàn)?；颊邿嵝筒灰?，可為稽留熱、間歇熱、弛張熱等?？砂榈脱獕夯蛐菘恕；颊叨啾憩F為白細胞增多，也有少部分患者表現為白細胞減少。偶爾報道有血小板減少癥、出血、黃疸、彌散性血管內凝血者。大多同時有皮膚癥狀，如紫癜、出血性水皰、膿皰瘡等。
2.下呼吸道感染 患者一般均有嚴重基礎疾病尤以慢性阻塞性肺病及支氣管肺癌為多。感染者常已在使用抗生素，并常有各種因素所致的免疫能力低下如使用免疫抑制劑、激素應用、化療放療等。誘發(fā)因素：以安置呼吸機最多，其他有氣管切開、氣管插管、胸腔穿刺、動靜脈插管、導尿、全身麻醉等?？捎邪l(fā)熱甚至高熱，多有咳痰，痰液可為白色、膿性或帶血絲，但在老年人中癥狀較少甚至無癥狀?？捎泻粑贝伲膭舆^速。感染可以表現為支氣管炎、肺炎、肺膿腫、胸腔積液。休克和轉移性病灶少見。X線表現不一，可以是葉性、支氣管炎性、空隙性或混合性，可以為單葉病變、多葉病變或彌漫性雙側病變等。
3.傷口感染 常見于燒傷創(chuàng)口、手術切口的感染。隨著各種手術的開展，幾乎各處都可有該菌感染，尤以胸骨縱隔和脊柱后方相對多見。
4.軟組織感染 在社區(qū)中感染的常見形式，如指甲下血腫、摔傷后軟組織感染。
5.心內膜炎 危險度最高的是靜脈藥癮者、人工瓣膜術后、心臟手術后患
6.腹部感染 由于該菌的遷徙或腸道穿孔到達腹膜或其他臟器而發(fā)病。目前胃腸源性的感染中該菌漸受重視，尤其在肝移植相關性感染者中更為多見。其他如肝的氣性壞疽，急性氣腫性膽囊炎和逆行胰膽管造影術后敗血癥，膽石淤積所致間歇梗阻的急性化膿性膽管炎，不伴腹水或穿孔的繼發(fā)于小腸梗阻后的腹膜炎等。
7.泌尿道感染 從無癥狀性細菌尿到腎盂腎炎均有報道。
8.中樞神經系統(tǒng)感染 陰溝腸桿菌可引起腦膜炎、腦室炎、腦膿腫等。
9.眼部感染 眼部手術是常見誘因，白內障手術多在老年人中進行，因而成為此類感染常見原因。
根據各系統(tǒng)的臨床表現、實驗室檢查等可判斷感染發(fā)生的部位，細菌培養(yǎng)到陰溝腸桿菌為確診依據，應注意免疫力低下的患者感染的臨床表現可不典型。陰溝腸桿菌感染應注意與其他革蘭陰性桿菌感染相鑒別，確診需培養(yǎng)或涂片檢測到陰溝腸桿菌。

陰溝腸桿菌敗血癥需與傷寒或副傷寒進行鑒別。