本病在竇道發(fā)生感染之前很少出現(xiàn)癥狀。典型病例是在尾部中線有細小凹坑但無任何感覺。凹坑有細孔，有的用淚囊探子也難以探入。這是原發(fā)竇道，距肛門5～6cm。感染后局部形成表淺膿腫，自行破潰或手術(shù)切開后流出膿液。膿腫排放稀薄膿液數(shù)日后漸愈，遺留一硬結(jié)。再次細菌感染可以出現(xiàn)另一膿腫。上述癥狀重復(fù)出現(xiàn)。如此反復(fù)出現(xiàn)，以致局部可出現(xiàn)幾個竇道口。這些竇道口可以非常接近，也可能有2～3cm距離。多數(shù)竇道口可容細探針通過。竇道深淺不一，最深可達數(shù)厘米。繼發(fā)的竇道多在原發(fā)竇道口的上方即“顱側(cè)”。據(jù)觀察常略偏向一側(cè)，尤以偏向左側(cè)者最多。在竇道區(qū)的“干燥期”可以在此處觸知一長橢圓形硬結(jié)或囊性腫物。
藏毛竇或藏毛囊腫的主要診斷標志是尾部急性膿腫或有分泌的慢性竇道，局部表現(xiàn)有疼痛、壓痛和炎癥浸潤，檢查時在中線位見到藏毛腔。

藏毛竇由癥狀和體征容易診斷，但應(yīng)與癤、肛瘺和肉芽腫鑒別。
1.癤癰 生長在皮膚，由皮膚突出，頂部呈黃色。癰有多個外孔，內(nèi)有壞死組織。
2.肛瘺 肛瘺的外口距肛門近，瘺管行向肛門，捫診有索狀物，肛管內(nèi)有內(nèi)口，有肛門直腸膿腫病史。而藏毛竇的走行方向多向顱側(cè)，很少向下。
3.其他 結(jié)核性肉芽腫與骨相連，X線檢查可見骨質(zhì)有破壞，身體其他部位有結(jié)核性病變。梅毒性肉芽腫有梅毒病史。梅毒血清反應(yīng)陽性。