本病在竇道發(fā)生感染之前很少出現(xiàn)癥狀。典型病例是在尾部中線有細(xì)小凹坑但無任何感覺。凹坑有細(xì)孔，有的用淚囊探子也難以探入。這是原發(fā)竇道，距肛門5～6cm。感染后局部形成表淺膿腫，自行破潰或手術(shù)切開后流出膿液。膿腫排放稀薄膿液數(shù)日后漸愈，遺留一硬結(jié)。再次細(xì)菌感染可以出現(xiàn)另一膿腫。上述癥狀重復(fù)出現(xiàn)。如此反復(fù)出現(xiàn)，以致局部可出現(xiàn)幾個(gè)竇道口。這些竇道口可以非常接近，也可能有2～3cm距離。多數(shù)竇道口可容細(xì)探針通過。竇道深淺不一，最深可達(dá)數(shù)厘米。繼發(fā)的竇道多在原發(fā)竇道口的上方即“顱側(cè)”。據(jù)觀察常略偏向一側(cè)，尤以偏向左側(cè)者最多。在竇道區(qū)的“干燥期”可以在此處觸知一長橢圓形硬結(jié)或囊性腫物。
藏毛竇或藏毛囊腫的主要診斷標(biāo)志是尾部急性膿腫或有分泌的慢性竇道，局部表現(xiàn)有疼痛、壓痛和炎癥浸潤，檢查時(shí)在中線位見到藏毛腔。

藏毛竇由癥狀和體征容易診斷，但應(yīng)與癤、肛瘺和肉芽腫鑒別。
1.癤癰 生長在皮膚，由皮膚突出，頂部呈黃色。癰有多個(gè)外孔，內(nèi)有壞死組織。
2.肛瘺 肛瘺的外口距肛門近，瘺管行向肛門，捫診有索狀物，肛管內(nèi)有內(nèi)口，有肛門直腸膿腫病史。而藏毛竇的走行方向多向顱側(cè)，很少向下。
3.其他 結(jié)核性肉芽腫與骨相連，X線檢查可見骨質(zhì)有破壞，身體其他部位有結(jié)核性病變。梅毒性肉芽腫有梅毒病史。梅毒血清反應(yīng)陽性。