馬內(nèi)菲青霉病常隱匿發(fā)病，潛伏期難以估計(jì)，臨床上本病分為病灶型與進(jìn)行播散型：
1.病灶型 原發(fā)病灶與真菌入侵門(mén)戶(hù)有關(guān)。由于病原主要由呼吸道入侵，因此原發(fā)癥狀主要在肺，臨床表現(xiàn)似肺結(jié)核，極易誤診。也可無(wú)癥狀或者有癥狀而被潛在疾病掩蓋。
2.進(jìn)行播散型 臨床表現(xiàn)復(fù)雜。主要累及肺、肝、腸、淋巴結(jié)、扁桃體、皮膚、骨、骨髓、腎和脾等器官。其中尤以肺和肝受累最多且嚴(yán)重?？捎械湫桶Y狀，突然發(fā)病，高熱、寒戰(zhàn)、食欲減退，進(jìn)行性消瘦，全身淋巴結(jié)腫大，肝脾大，咳嗽，心包炎，貧血、白細(xì)胞升高及播散性膿腫等。皮膚損害是播散型馬內(nèi)菲青霉病的臨床特征，常成為播散型病例首先引起注意的體征。皮損常見(jiàn)于面部、軀干上部及上肢，皮損種類(lèi)多樣，可出現(xiàn)丘疹、斑丘疹、結(jié)節(jié)、壞死性丘疹、傳染性軟疣樣丘疹、痤瘡樣損害、毛囊炎及潰瘍等。有人認(rèn)為壞死性丘疹是本病最特征性的表現(xiàn)，隆起于皮膚的丘疹中央發(fā)生壞死，壞死處凹陷呈臍窩狀。皮損中容易查到馬內(nèi)菲青霉，對(duì)臨床診斷很有幫助。
本菌的廣泛存在及侵犯臟器的多樣性，使得診斷非常困難?；颊邽樯l(fā)罕見(jiàn)病例，更增加了診斷的難度。楊氏總結(jié)以下幾點(diǎn)可供診斷時(shí)參考：
1.機(jī)體免疫功能低下及野外活動(dòng)接觸疫源為病情診斷線(xiàn)索。
2.臨床表現(xiàn) 發(fā)熱、畏寒、咳嗽、咳痰、消瘦乏力、肝和脾及淺淋巴結(jié)腫大、皮疹、皮下結(jié)節(jié)或膿腫等。病情的復(fù)雜多樣性為其特點(diǎn)之一。
3.白胞顯著增多，不同程度的貧血。
4.各種抗生素?zé)o效。
5.血清學(xué)檢驗(yàn)有PM的特異性抗體，血PM免疫擴(kuò)散試驗(yàn)陽(yáng)性有助診斷。
6.病理標(biāo)本可有上述3大特征表現(xiàn)。
7.真菌培養(yǎng)出的PM為雙相菌，并要能與莢膜組織胞漿菌鑒別。

需與莢膜組織胞漿菌病鑒別。取病變組織進(jìn)行培養(yǎng)鑒定，則可完全區(qū)別。