1.腸內合并癥
(1)腸出血：深潰瘍可侵蝕血管引起程度不等的腸出血，有時成為本病的主要癥狀。大量出血少見。
(2)腸穿孔：多發(fā)生于暴發(fā)型及有深潰瘍的患者，穿孔部位以盲腸、闌尾和升結腸為多見，穿孔后可引起局限性或彌漫性腹膜炎。急性穿孔較少見，慢性穿孔較多，大多無劇烈的腹痛發(fā)作，穿孔發(fā)生的時間常難以確定，但全身情況逐漸惡化。X線檢查可見游離氣體而確診。有時由于先形成粘連，穿孔后可形成局部膿腫，或穿入附近器官而形成內瘺。
(3)阿米巴性闌尾炎：盲腸部病變易蔓延至闌尾。臨床癥狀與一般闌尾炎相似，但易發(fā)生穿孔。據(jù)稱熱帶、亞熱帶地區(qū)因闌尾炎而手術者，發(fā)現(xiàn)約1/3為阿米巴感染所致。
(4)結腸肉芽腫：慢性病例由于黏膜增生，發(fā)生肉芽腫，形成大腫塊，極似腫瘤，稱為阿米巴瘤，極易誤診為腸癌。多見于盲腸、乙狀結腸及直腸等處。
2.腸外合并癥 溶組織內阿米巴滋養(yǎng)體可自腸壁靜脈、淋巴管或直接蔓延，播散至肝、腹腔、肺、胸膜、心包、腦、泌尿生殖道或鄰近皮膚，形成膿腫或潰瘍，其中以阿米巴肝膿腫最常見。